Schutzpatron von Borghetto di Vara ist der heilige Karl Borromäus, gefeiert am 4. November. Die ihm geweihte Erzpriesterkirche wurde zwischen 1615 und 1618 errichtet, in einem zentralen Ortsteil, einst Sogiora genannt, heute Piazza Umberto I, anlässlich der Abtrennung des Gebiets von Borghetto von der Pfarrei Ripalta: Die Wahl des Schutzpatrons erfolgte nach einer eigentümlichen Methode, indem man viele Kerzen anzündete, jede einem bestimmten Heiligen zugeordnet, und dem am längsten brennenden das Patronat zusprach, das eben jenes des heiligen Karl Borromäus war. Die erste Messe wurde am 8. Oktober 1618 feierlich zelebriert, und im folgenden Jahr wurde die Kirche zur Pfarrei erhoben.
1943, während des Zweiten Weltkriegs, beherbergten die Kellerräume der Kirche vorübergehend rund 35.000 Bände der Bibliothek „U. Mazzini“ von La Spezia: Im folgenden Jahr zerstörte ein heftiger alliierter Luftangriff die Kirche aus dem 17. Jahrhundert samt den Büchern und ließ nur den Glockenturm stehen, der noch heute über dem Ort emporragt. Die Pfarrei fand dann in der neuen Kirche Sacro Cuore di Gesù, erbaut entlang der Via Aurelia zwischen 1926 und 1937, ihren Sitz. Der Ort bewahrt zudem die Kirche San Michele Arcangelo im Weiler Cassana, die ein dem Maler Nicolò Vespesiano zugeschriebenes Triptychon von 1555 bewahrt.