Le saint patron de Borghetto di Vara est saint Charles Borromée, fêté le 4 novembre. L'église archiprêtrale qui lui est dédiée fut édifiée entre 1615 et 1618, dans une zone centrale du bourg alors appelée Sogiora, aujourd'hui Piazza Umberto I, à l'occasion du détachement du territoire de Borghetto de la paroisse de Ripalta : le choix du saint patron se fit selon une méthode curieuse, en allumant de nombreuses bougies, chacune correspondant à un saint donné, et en attribuant le patronage à celle qui resterait allumée le plus longtemps, qui fut justement celle de saint Charles Borromée. La première messe fut célébrée solennellement le 8 octobre 1618, et l'année suivante l'église fut érigée en paroisse.
En 1943, pendant la Seconde Guerre mondiale, les sous-sols de l'église abritèrent temporairement environ 35 000 volumes de la Bibliothèque « U. Mazzini » de La Spezia : l'année suivante, un violent bombardement aérien allié détruisit l'église du XVIIe siècle avec les volumes, ne laissant debout que le clocher, qui domine encore aujourd'hui le bourg. La paroisse trouva ensuite refuge dans la nouvelle église du Sacré-Cœur de Jésus, construite le long de la Via Aurelia entre 1926 et 1937. Le bourg conserve aussi l'église San Michele Arcangelo, dans le hameau de Cassana, qui abrite un triptyque de 1555 attribué au peintre Nicolò Vespesiano.