In Muggia sprach man eine Sprache, die heute niemand mehr spricht. Sie hieß Muglisano, war eine ladinische Mundart, dem Friaulischen ähnlich, und Ende des neunzehnten Jahrhunderts erlosch sie. Die letzten Zeugnisse sammelte 1889 der Abbé Jacopo Cavalli, der jene aufsuchte, die sie noch konnten; seine zuverlässigste Quelle war Niccolò Bortoloni, der letzte der Muglisani, gestorben Anfang 1898. Lange Zeit hatte jene Sprache, bevor sie verschwand, neben der anderen bestanden, dem istrovenetischen Muggesano, das man noch spricht: zwei Mundarten in demselben Mund, bis eine von beiden aufhörte. Muggia ist die südlichste Gemeinde Friaul-Julisch Venetiens und, zusammen mit San Dorligo della Valle, der einzige Zipfel Istriens, der Italien geblieben ist; von den westlichen Spitzen der Landzunge sieht man die Sonne in der Adria untergehen, was in Italien an sehr wenigen Orten geschieht.
Auch die Siedlung hat den Platz gewechselt. Der erste Kern war eine vorgeschichtliche Fliehburg auf dem Hügel, der heute Muggia Vecchia heißt, später ein römisches Lager; der Name erscheint zum ersten Mal in einer Urkunde von 931, als die Könige von Italien Hugo und Lothar das Castellum Mugla dem Patriarchen von Aquileia schenkten. Am Ende des fünfzehnten Jahrhunderts jedoch stieg die Bevölkerung zum Meer hinab, und der Ortskern verlagerte sich dorthin, wo er heute liegt. Unter den Habsburgern kamen die Werften, und aus einem Ort von Fischern und Küstenhandel wurde Muggia eine Arbeiterstadt; aus dieser Tradition kam auch der istrische Widerstand, mit den Namen Alma Vivoda, Natale Colarich und Luigi Frausin, und die Silbermedaille für militärische Tapferkeit. Im Oktober 1954 verlor die Gemeinde mit der Grenzregelung ein Drittel ihres Gebiets und die östlichen Fraktionen, und mehr als zweitausendsiebenhundert Menschen verließen ihre Häuser, um nach Italien zu ziehen.