Schutzpatron von Germignaga ist der heilige Johannes der Täufer, gefeiert am 24. Juni in der Kirche Santi Giovanni Battista e Rocco.
Eine der ältesten Traditionen des Ortes ist die Intiéro-Prozession, am Karfreitag abgehalten und durch lokale Überlieferung seit mindestens 1686 belegt, der eine Darstellung der Kreuzabnahme vorausgeht. Das Fest der Madonna del Rosario, traditionell am ersten Sonntag im Oktober mit einer Prozession durch die Straßen des Ortes gefeiert, ist mit der Zubereitung des Croccante di Germignaga verbunden, einer Süßspeise aus Mandeln, Zucker und Honig. In der Nacht des 31. Dezember findet hingegen die traditionelle Veranstaltung «Se brusa ul vecc» statt. Der Ort bewahrt zudem die Kirche San Carlo Borromeo.