Le saint patron de Germignaga est saint Jean-Baptiste, fêté le 24 juin dans l'église Santi Giovanni Battista e Rocco.
L'une des traditions les plus anciennes du village est la procession de l'Intiéro, célébrée le Vendredi saint et documentée par la tradition locale depuis au moins 1686, précédée par la représentation de la déposition. La fête de la Madonna del Rosario, traditionnellement célébrée le premier dimanche d'octobre avec une procession dans les rues du village, est liée à la préparation du croccante di Germignaga, une douceur à base d'amandes, de sucre et de miel. La nuit du 31 décembre se tient en revanche la manifestation traditionnelle «Se brusa ul vecc». Le village conserve aussi l'église San Carlo Borromeo.
