Schutzpatron von Valtopina ist der heilige Bernhardin, gefeiert am 20. Mai. Ab der zweiten Hälfte des 15. Jahrhunderts wurde, wahrscheinlich um den Talbewohnern wirtschaftliche Eigenständigkeit zu sichern, der Jahrmarkt des heiligen Bernhardin eingerichtet, der am Zusammenfluss des Flusses Topino mit dem Fosso dell'Anna stattfand, in dessen Nähe auch die Kirche San Pietro de Cerqua erbaut worden war. Cerqua wurde zum Namen des an der Via Flaminia entstandenen Dorfes, das dem heutigen Borgo di Valtopina entspricht: Der bis ins vergangene Jahrhundert in der amtlichen Kartografie geführte Ortsname wird von den Bewohnern noch heute verwendet.
Obwohl auf den den Hauptort umgebenden Höhen eine bedeutende vorrömische Besiedlung nachgewiesen wurde, kann die Geschichte des Topino-Tals als mit dem Bau der Via Flaminia im 3. Jahrhundert v. Chr. beginnend gelten, von der noch interessante Fundstücke erhalten sind; der bedeutende Verkehrsknotenpunkt im Talgrund begünstigte die Besiedlung der umliegenden Hügelgebiete, wie die Überreste einer römischen Landvilla belegen. Bis ins 19. Jahrhundert lebte der Großteil der Bevölkerung in den alten Hügeldörfern, und die Burg von Poggio behielt ihre Funktion als Verwaltungssitz; erst mit dem Bau der Eisenbahnlinie Rom-Ancona und der fortschreitenden Verlagerung der Wirtschaftstätigkeiten in den Talgrund wurde der Gemeindesitz 1867 in die Villa della Cerqua verlegt, die später Valtopina genannt wurde.