Die Altstadt liegt auf einer Insel, die der Fluss Liri bildet, der sich auf Höhe der Burg Boncompagni-Viscogliosi in zwei Arme teilt und zwei Fälle von je etwa dreißig Metern macht. Der erste ist die Cascata Grande, rund siebenundzwanzig Meter hoch: einer der ganz wenigen Wasserfälle Italiens — neben dem von Nepi —, der mitten in der Altstadt einer Stadt stürzt. Der andere, der Valcatoio, ist weniger eindrucksvoll, weil sein Wasser gefasst wird, um ein Kraftwerk zu speisen. Der Name kommt von der Insel: Die erste überlieferte Form ist Insula Filiorum Petri, die Insel der Söhne des Petrus, Gastalden von Sora, und eine Urkunde von 1004 nennt bereits einen Colle dell'Isola. Jahrhundertelang hieß der Ort einfach Isola, mitunter Isola di Sora, denn er blieb bis in napoleonische Zeit an die Nachbarstadt gebunden; nach der Einigung wurde er 1863 zu Isola presso Sora und erhielt den heutigen Namen erst 1869.
Im Jahr 1579 kaufte Papst Gregor der Dreizehnte den Della Rovere das Lehen des Herzogtums Sora ab, um es dem neuen Herzog Giacomo Boncompagni, seinem Sohn, zu geben: Viele Jahre lang war Isola Sitz der Herzöge und seine Burg das wichtigste Verwaltungszentrum des Herzogtums. Im Mai 1799 kam es in der Kirche San Lorenzo Martire zu einem Massaker: Mehr als fünfhundert Menschen, die dort Zuflucht gesucht hatten, wurden vom Revolutionsheer getötet. Dann kam das Papier. Im zweiten Jahrzehnt des neunzehnten Jahrhunderts richtete Carlo Lefebvre hier die ersten Papiermühlen ein, und zwischen 1821 und 1841 entstanden im Liri-Tal viele weitere, die meisten davon in Isola: Aus einem kleinen ländlichen Ort wurde ein Industriezentrum ersten Ranges, und man nannte ihn das Manchester Italiens, aber auch das kleine Paris, wegen der vielen Franzosen — aus Paris und Lyon —, die hierher zum Leben und Arbeiten kamen. Unter den Familien, die sich niederließen, waren die Montgolfier, Papierfabrikanten. Neben den Papiermühlen entstanden Filzfabriken, eine Manufaktur für hochwertige Tapeten und Wollfabriken, die erste 1805 von Clemente und Vittorio Simoncelli gegründet; und dank der Kraftwerke am Fluss war Isola zu Beginn des zwanzigsten Jahrhunderts einer der ganz wenigen Orte der Gegend mit elektrischem Strom für öffentliche und private Nutzung. Seit 1988 findet hier das Festival Liri Blues statt, seit der ersten Ausgabe kostenlos, und 1997 schloss der Ort eine Partnerschaft mit New Orleans.