La patronne de Mergozzo est Notre-Dame de l'Assomption, fêtée le 15 août dans l'église Beata Vergine Assunta.
En juin 1889, face au refus du curé de Mergozzo de monter au village pour célébrer la fête de saint Jean, patron des tailleurs de pierre, les habitants se tournèrent vers le pasteur de l'église évangélique d'Intra. Le village conserve aussi l'église Santa Marta et l'oratoire Santa Maria della Natività e Sant'Anna, ainsi que le musée archéologique municipal.