Dieser Ort gehörte tausend Jahre lang einer Abtei. Der Name kommt vom lateinischen civitatula, kleine Stadt, und wahrscheinlich ist der Platz einer jener, in die die Leute der capenatischen Städte zogen, vielleicht aus Capena selbst nach dessen Aufgabe zwischen dem vierten und dem fünften Jahrhundert. Doch das Dokument, das ihn bezeugt, ist eine Bulle Papst Gregors VII. von 1081, in der er als Civitas de Colonis erscheint — und dieses «de Colonis» sagt, dass er eine Kolonie war, also ein unmittelbar vom Kirchenstaat gegründeter Ort. In derselben Bulle gehört der Ort zum Kloster San Paolo fuori le Mura, dem Gregor VII. eine ungeheure Macht verlieh: die Befugnis, von weltlicher und kirchlicher Gewalt losgelöst zu sein, allein die des Papstes ausgenommen, und die Gerichtsbarkeit über ein ausgedehntes Gebiet zwischen dem rechten Tiberufer, der via Cassia und dem Monte Soratte. Im Mittelalter hatte Civitella auch einen eigenen Flusslandeplatz, Barcana genannt, nach einem Boot, das die Gemeinschaft des Tibertals unterhielt.
Wie viele Menschen dort lebten, weiß man über das Salz: 1416 erscheint der Ort in der Liste der Gemeinschaften, die der Salzsteuer und der Herdsteuer unterlagen, mit einem Verbrauch von zehn rubbi, was einer geschätzten Bevölkerung von achthundertfünfzig entspricht. Das Lehen entglitt den Mönchen mehr als einmal und kehrte zurück — es ging an die Colonna, dann an zwei Gläubiger des Papstes aus Narni für fünftausend Gulden — bis die Mönche von San Paolo es am achtzehnten März 1452 für zweitausend Dukaten zurückkauften. Zwischen 1802 und 1803 wurde die Gemeinschaft, die sechshundert Einwohner zählte und schon von der Hungersnot heimgesucht war, von einer Epidemie bösartigen Fiebers getroffen: hundertzwanzig Menschen starben, dazu zwei Ärzte. In amtlichen Papieren zwischen dem siebzehnten und dem neunzehnten Jahrhundert benutzte der Ort einen runden Trockenstempel mit dem Patron Jakobus dem Älteren, der Stab und Pilgerhut hält, und der Aufschrift Civitelle S.P. Castrum. Die Bindung an die Abtei endete erst vor kurzem: nach tausendjährigem Besitz überließ die Abtei San Paolo 1996 die Burg der Gemeinde.