Schutzpatron von Nettuno ist der heilige Rochus, gefeiert am 16. August. In den Jahren 1625-1626 restaurierte der Kirchenstaat den Stadtkern und baute die ihm geweihte Bastion wieder auf; Anfang des 20. Jahrhunderts wuchs die Stadt nach Osten hin, verbunden mit dem Wiederaufbau der Kirche San Rocco in der heutigen Via Matteotti. 1914 zerstörte ein schwerer Brand das Gebäude und beschädigte auch den Thron der Statue Unserer Lieben Frau von der Gnade: Die Nettuner antworteten mit der Einweihung des neuen, von den Passionisten wiederaufgebauten Heiligtums, die bis heute seine Hüter sind. Im Inneren, auf dem Hauptaltar, ist ein Gemälde von Andrea Sacchi zu bewundern, das die Madonna von Loreto zusammen mit dem heiligen Josef, dem heiligen Bartholomäus, dem heiligen Rochus und dem heiligen Franziskus zeigt.
1656 dezimierte eine Pestepidemie über tausend Einwohner von Nettuno, was zur Gründung des Monte Frumentario zur Verteilung von Getreide an die Ärmsten führte. Die Stadt bewahrt zudem das Forte Sangallo, auf Geheiß der Borgia errichtet und Antonio da Sangallo dem Älteren anvertraut, um den Kirchenstaat vor Räubern und Piraten zu schützen, sowie den eindrucksvollen mittelalterlichen Ortskern, der wahrscheinlich nahe der antiken, noch ungewissen Lage des römischen Hafens liegt.