El patrono de Nettuno es san Roque, festejado el 16 de agosto. En el bienio 1625-1626 los Estados Pontificios restauraron el núcleo urbano y reconstruyeron el baluarte a él dedicado; a principios del siglo XX la ciudad se desarrolló hacia levante con la reconstrucción de la iglesia de San Rocco, situada en la actual vía Matteotti. En 1914 un grave incendio destruyó el edificio, dañando también el trono de la estatua de Nuestra Señora de las Gracias: los nettunenses respondieron inaugurando el nuevo santuario, reconstruido por los padres pasionistas, que todavía hoy son sus custodios. En su interior, sobre el altar central, puede admirarse un retablo de Andrea Sacchi que representa a la Virgen de Loreto junto a san José, san Bartolomé, san Roque y san Francisco.
En 1656 una epidemia de peste diezmó a más de mil habitantes de Nettuno, llevando a la creación del Monte Frumentario para la distribución de trigo a los más pobres. La ciudad conserva también el Forte Sangallo, mandado construir por los Borgia y confiado a Antonio da Sangallo el Viejo para defender los Estados Pontificios de los asaltos de bandoleros y piratas, y el sugestivo casco medieval, que se alza probablemente cerca del antiguo y todavía incierto emplazamiento del puerto romano.
