Acqualagna liegt dort, wo der Burano in den Candigliano mündet, an der Flaminia, gleich hinter der Schlucht des Furlo. Woher der Name kommt, weiß man nicht: eine Annahme leitet ihn von acqua-lama her, also Sumpfwasser, wegen der Nässe, die einst im Bereich des Zusammenflusses lag. Der Ort entstand wahrscheinlich um die Abtei San Vincenzo al Furlo, die eine Kapelle und ein Hospital hatte. Von jener Abtei des achten Jahrhunderts bleibt einiges: der heilige Romuald wohnte dort 1011 und der heilige Petrus Damiani 1042; das Kloster war bis ins elfte Jahrhundert unabhängig und geriet dann in den Einflussbereich von Fonte Avellana; die heutige romanische Kirche wurde 1271 von Abt Bonaventura neu errichtet und bewahrt eines der beiden ursprünglichen Schiffe, eine dreischiffige Krypta mit alten Kapitellen und einen Altar des neunten Jahrhunderts, dazu Reste mittelalterlicher Fresken. Ganz in der Nähe steht auch eine kleine römische Brücke. Im Jahr 1506 hielt sich Papst Julius II. in Acqualagna auf und ordnete den Bau der Kirche Santa Lucia an.
Das Wappen der Gemeinde erzählt dagegen von einem kleinen Ehrgeiz. Der Falke auf einem dreigipfligen Berg stammt aus dem Blason der Grafen Accomanducci von Montefalcone, die den Ort seit dem fünfzehnten Jahrhundert beherrschten. 1867 jedoch wurde der Falke gekrönt dargestellt, mit einer Klaue ein silbernes Schildchen haltend, das eine Leiter zeigte: nach der Absicht der Gemeinde sollte jene Leiter an die Familie der Grafen Della Scala erinnern. Als 1960 das amtliche Gemeindewappen verliehen wurde, war die Leiter verschwunden, und an ihrer Stelle stand ein blau-rot geschachter Pfahl. Im Gebiet hat die Villa von Colombara die Reste eines römischen Gutshofs des zweiten Jahrhunderts vor Christus ergeben, mit einem weiten Säulenhof, um den die Wohnräume und die Räume zur Verarbeitung der Feldfrüchte lagen, in früher Kaiserzeit teilweise über dem ersten neu gebaut; und auf dem Berg von Pietralata steht eine Burg des elften Jahrhunderts mit der noch geweihten Kirche der Santissima Trinità und einem Kanonikerhaus, das mit der Kirche durch einen Hängegang verbunden ist. Im Jahr 1901 wurde in der Fraktion Farneta der Brigant Giuseppe Musolino gefasst. Heute kennt man den Ort vor allem für den Trüffel: die nationale Messe findet dreimal im Jahr statt, im Februar für den schwarzen, im August für den schwarzen Sommertrüffel und zwischen Oktober und November für den weißen.