Acqualagna está donde el torrente Burano desemboca en el Candigliano, a lo largo de la Flaminia, nada más pasada la garganta del Furlo. De dónde viene el nombre no se sabe: una hipótesis lo hace derivar de acqua-lama, es decir agua de pantano, por las zonas encharcadas que antes había en el área de la confluencia. El poblado nació probablemente alrededor de la abadía de San Vincenzo al Furlo, que tenía una capilla y un hospital. De aquella abadía del siglo octavo queda bastante: san Romualdo vivió allí en 1011 y san Pedro Damián en 1042; el cenobio fue independiente hasta el siglo once, luego entró en la órbita de Fonte Avellana; la iglesia actual, románica, fue reedificada en 1271 por el abad Bonaventura y conserva una de las dos naves primitivas, una cripta de tres naves con capiteles antiguos y un altar del siglo noveno, además de restos de frescos medievales. Allí cerca hay también un pequeño puente romano. En 1506 el papa Julio II se detuvo en Acqualagna y ordenó la construcción de la iglesia de Santa Lucia.
El escudo del municipio cuenta en cambio una pequeña ambición. El halcón posado sobre un monte de tres cimas viene del blasón de los condes Accomanducci de Montefalcone, que dominaron el lugar desde el cuatrocientos. En 1867, sin embargo, el halcón fue representado coronado y sujetando con una garra un escudete de plata cargado con una escalera de mano: según las intenciones del Ayuntamiento, aquella escalera debía recordar a la familia de los condes Della Scala. Cuando en 1960 se concedió el escudo cívico oficial, la escalera había desaparecido, y en su lugar había un palo jaquelado de azul y rojo. En el territorio, la villa de Colombara ha devuelto los restos de una granja romana del siglo segundo antes de Cristo, con un amplio patio porticado alrededor del cual estaban las viviendas y los locales para la elaboración de los productos agrícolas, reconstruida en época imperial parcialmente encima de la primera; y en el monte de Pietralata hay un castillo del siglo once con la iglesia de la Santissima Trinità todavía consagrada y una casa canónica unida a la capilla por un pasaje suspendido. En 1901, en la pedanía de Farneta, fue capturado el bandido Giuseppe Musolino. Hoy el pueblo se conoce sobre todo por la trufa: la feria nacional se celebra tres veces al año, en febrero para la negra, en agosto para la negra de verano y entre octubre y noviembre para la blanca.