Schutzpatrone von Martina Franca sind der heilige Martin von Tours, gefeiert am 11. November, und die heilige Comasia, Märtyrerin zwischen dem 2. und 4. Jahrhundert, deren Reliquien zusammen mit denen der heiligen Martina in der Minderbasilika San Martino an der Piazza Plebiscito bewahrt werden: Das heutige Gebäude wurde zwischen 1747 und 1785 über einer früheren romanischen Kirche errichtet, im April 1998 von Papst Johannes Paul II. zur Minderbasilika erhoben und im September 2002 von der Unesco zum „Denkmal-Botschafter einer Kultur des Friedens“ erklärt. Die beiden Patrone werden auch beim sommerlichen Patronatsfest gemeinsam gefeiert, am ersten Wochenende nach dem 4. Juli.
Der Name „Martina“ stammt von der Verehrung der Einwohner für den heiligen Martin seit dem Jahr 1000, als die erste Siedlung genau auf dem gleichnamigen Hügel entstand. Das Beiwort „Franca“ wurde am 12. August 1310 von Philipp I. von Anjou, Fürst von Tarent, hinzugefügt, der dem Ort verschiedene Steuerbefreiungen und ewigen Krongut-Status gewährte und ihm zudem ein Wappen mit einem frei über grüne Wiese galoppierenden weißen Pferd verlieh, dem er die goldene angiovinische Lilie hinzufügte. Als der ewige Krongut-Status im Laufe der Zeit verloren ging, verschwand das Beiwort, um erst nach der italienischen Einigung 1861 wiederhergestellt zu werden, als der Ort endgültig in Martina Franca umbenannt wurde.