Les saints patrons de Martina Franca sont saint Martin de Tours, fêté le 11 novembre, et sainte Comasia, martyre entre les IIe et IVe siècles, dont les reliques sont conservées avec celles de sainte Martina dans la basilique mineure San Martino, place Plebiscito : l'édifice actuel fut construit entre 1747 et 1785 sur une église romane antérieure, élevé au rang de basilique mineure par le pape Jean-Paul II en avril 1998 et déclaré par l'Unesco « monument messager d'une culture de paix » en septembre 2002. Les deux patrons sont aussi fêtés ensemble lors de la fête patronale estivale, le premier week-end après le 4 juillet.
Le nom « Martina » vient de la dévotion des habitants à saint Martin dès l'an mille, lorsque le premier établissement naquit précisément sur la colline du même nom. L'adjectif « Franca » fut ajouté le 12 août 1310 par Philippe Ier d'Anjou, prince de Tarente, qui accorda au bourg diverses franchises fiscales et le statut de domaine perpétuel, lui octroyant aussi des armoiries représentant un cheval blanc courant librement sur un pré vert, auquel il ajouta le lys doré angevin. Le statut de domaine perpétuel s'étant perdu avec le temps, l'adjectif disparut, pour n'être rétabli qu'après l'unité italienne, en 1861, lorsque le bourg fut définitivement rebaptisé Martina Franca.