Sant'Agapito, municipio definido como «puerta del Matese» por su posición en las estribaciones noroccidentales del macizo, toma el nombre de su patrono, el mártir cristiano Agapito, al que estaba dedicada la iglesia en torno a la cual se desarrolló el núcleo urbano original: de «Sanctum Agapitum», el nombre del pueblo se transformó en «Santa Capiata» en 1516.
El territorio formó parte del condado de Isernia en época longobarda y del condado de Molise en época normanda; en el siglo XII se convirtió en feudo de una familia que tomó su nombre. El pueblo conserva hoy la iglesia de San Nicola di Bari, iglesia madre del municipio, en el centro histórico, de estructura románica, alzada sobre los restos de un antiguo templo pagano: sus dos fachadas, una en la via Carbonari y la otra en la via Manzoni, permiten ver su entrada desde ambas calles principales del pueblo, y en su interior se pueden admirar numerosas estatuas de santos. Sant'Agapito comprende hoy también las aldeas de Colannoni, Coriemano, Pietradonata, Scalo Ferroviario y Temennotte.
