Au temps des judicats le village s'appelait Nughes, ou Nugis, d'après les noyers; il appartenait au judicat de Cagliari et, après 1258, passa à Ugolin della Gherardesca, puis à Pise et puis aux Aragonais, qui le confièrent à divers feudataires. Et à partir de 1397 environ les papiers le donnent vide: le village de Nuxis est enregistré comme dépeuplé, et dépeuplé il reste. Il ne fut repeuplé qu'au dix-huitième siècle, et alors il grandit jusqu'à devenir l'un des centres les plus importants du Sulcis. Commune, pourtant, il ne l'était pas: il l'est devenu en 1957, en se détachant de Santadi. Un habitat plus vieux que les judicats est donc une commune autonome depuis moins de soixante-dix ans.
Ce qui est dessous est bien plus ancien. Le territoire est habité depuis le néolithique — la nécropole de S'Acqua Cadda est de culture Monte Claro — et à l'âge du bronze appartiennent plusieurs nuraghes et le puits sacré de Tattinu. Près de ce même endroit se dresse l'église de Sant'Elia di Tattinu, un petit édifice de moins de cent mètres carrés, à quelques centaines de mètres du village, et l'un des rares exemples d'architecture byzantine en Sardaigne. Le reste de ce qui est sous terre a été extrait pendant des millénaires: le récit local énumère treize mines abandonnées une par une — Bau Pressiu, Bacchera e Tattinu, Is Ollargius, Is Piras, Sa Marchesa, Serra Sirbonis et les autres — et parmi ce qui en sortait il y a un marbre noir rare, le marbre de Nuxis, appelé aussi Tamara.
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