Il patrono di Santo Stefano di Magra è santo Stefano Protomartire, festeggiato il 3 agosto. La pieve a lui intitolata è citata in uno scritto di papa Anastasio IV del 1154; già nel 981, nel diploma imperiale di Ottone II di Sassonia, il borgo era ricordato come importante sede di mercato lungo la via Francigena, la strada dei pellegrini diretti a Roma. L'attuale chiesa parrocchiale, nel centro storico, fu edificata nel corso del Settecento su quell'antica pieve trecentesca: progettata dal genovese Ferdinando d'Andrea, fu aperta al culto nel 1764.
Nella frazione di Ponzano Magra sorge invece il santuario di Nostra Signora delle Grazie, la cui edificazione seguì un'apparizione mariana al ragazzo Giovanni Battistini, avvenuta secondo la tradizione il 10 luglio 1647 sul poggio dei Castiglioni: la prima pietra fu benedetta dal vescovo il 24 agosto 1648, e all'interno è ancora oggi conservata ed esposta una Madonna con il Bambino di Domenico Beccafumi.



