Il patrono di Malnate è san Martino, festeggiato l'11 novembre nella Chiesa di San Martino.
Dal primo sabato di settembre, da 76 anni, si tiene presso la parrocchia la classica Sagra Settembrina: cucina tipica, ospiti musicali, sport, giochi e mostre accolgono la cittadinanza. A fine agosto la parrocchia di San Lorenzo organizza invece «Gurone in Festa». Il territorio comunale conserva anche il Parco Valle del Lanza e il monumento naturale delle cave di Molera.