Le saint patron de Mignanego est saint Jean-Baptiste, fêté le 24 juin. L'église paroissiale Sant'Ambrogio, au chef-lieu, est mentionnée dans un document du 31 mars 1210, et au XIIIe siècle les deux rectorats de Fumeri et Paveto furent rattachés à sa pieve.
Parmi les événements historiques les plus importants du bourg figure la bataille livrée le 10 mai 1625 au col du Pertuso, qui vit la victoire des milices volontaires locales, conduites par le curé de Montanesi, sur l'armée du duc Charles-Emmanuel Ier de Savoie : en remerciement de l'issue de la bataille fut érigé le sanctuaire de Nostra Signora della Vittoria. La zone fut de nouveau théâtre de combats en 1746-1747, pendant la guerre de Succession d'Autriche, puis encore en 1800, lorsque les troupes françaises furent vaincues par le général autrichien Hohenzollern. À partir de la seconde moitié du XIXe siècle, la vallée de la Polcevera connut un fort développement industriel, avec l'implantation à Mignanego de la société Brignola pour la production de céruse.