Il patrono di San Daniele del Friuli è sant'Agostino, che si ricorda il 28 agosto, mentre il giorno festivo del paese cade il 29 settembre, san Michele arcangelo: a lui sono intitolati il duomo e la parrocchia, che è anche sede della Forania di San Daniele, venti parrocchie dell'arcidiocesi di Udine.
Alla chiesa di San Michele è legata anche la cosa di cui la città va più fiera dopo il prosciutto: nel 1466 Guarnerio d'Artegna le donò 173 codici manoscritti, e nacque così la Biblioteca guarneriana, una delle più antiche biblioteche pubbliche d'Italia. Vi si conservano opere miniate, una rara edizione trecentesca dell'Inferno di Dante e la Bibbia Levantina, dove le miniature mescolano modi occidentali e levantini.
