Il patrono di Prelà è san Giovanni Battista, festeggiato il 24 giugno. La chiesa parrocchiale a lui dedicata, nel capoluogo di Molini, è detta anche «del Groppo» e fu eretta nel XV secolo: al suo interno si conserva il polittico della Madonna con i santi Pietro e Paolo, con gli scomparti superiori di san Giovanni Battista, della Pietà e di san Mauro, realizzato nel 1523 dai pittori Agostino da Casanova e, probabilmente suo maestro, Stefano Adrechi.
Nella frazione di Valloria si trova la chiesa parrocchiale dei Santi Gervasio e Protasio, il cui primo impianto risale al XV secolo, sebbene la struttura sia stata rivista nello stile architettonico barocco nel 1689 dall'architetto Angelo Battarello. Fra gli altri edifici religiosi del territorio figurano l'oratorio di San Giovanni Battista, eretto in stile barocco nella frazione di Villatalla, e la chiesa di San Sebastiano nella località di Casa Carli.