Negli annali di Longone c'è scritto che la prima vittima della peste del 1630 fu un contadino della frazione Arsago, Bartolomeo De Conti. Il curato Francesco Piantanida andò a portargli l'estrema unzione e gli scrisse il testamento, martedì 30 luglio; il giorno dopo morì anche lui, della stessa malattia. Dopo quell'anno la peste non tornò più, ma nell'agosto del 1836 arrivò il colera: chi si ammalava moriva in un giorno e veniva sepolto di notte.
Il paese sta in una conca di colline moreniche, accanto al lago del Segrino, che si chiama così perché gli antichi lo avevano dedicato agli dèi: Fonte Sacra, poi Sacrino, poi Segrino. Al centro dell'abitato c'è una torre quadrata di blocchi lavorati, che esisteva già nel 990 e serviva da casello daziario sulla strada per i piani d'Erba. E il 5 dicembre 1853 il comune decise di dividere in lotti i boschi comunali, dove fino ad allora tutti potevano tagliare legna e far pascolare le bestie, e di darne uno a ogni famiglia.
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