Modugno heißt «in der Mitte»: von Medunium, in medio, weil der Ort auf halbem Weg zwischen Bitonto und Bari lag, und in der römischen Zenturiation entstand sein erster Kern genau auf der Grenze zwischen dem Ager von Bitonto und dem von Bari. Diese Grenze steht noch auf den Feldern: In der Landschaft um Modugno finden sich die «titoli», die Renaissancesteine, die sie markierten. Zum ersten Mal erscheint der Name im Mai 1021 in einer Urkunde, und es ist kein feierlicher Akt: Ein gewisser Traccoguda «de loco Medunio» leiht zwei Männern aus Bitetto acht Soldi und nimmt einen Weinberg als Pfand. So beginnt ein Ort, mit einem Darlehen und einem Weinberg.
Außerhalb der Stadt liegt eine der schönsten mittelalterlichen Stätten Apuliens: Balsignano, das befestigte Gehöft, seit 962 bezeugt, von den Sarazenen geplündert, wieder aufgebaut, an die Benediktiner übergegangen und schließlich 1526 im Krieg zwischen Anjou und Aragón zerstört. Geblieben sind die Mauern, die Türme, die Kirche San Felice über griechischem Kreuz mit ihrer Kuppel auf achteckigem Tambour und die von Santa Maria di Costantinopoli, die Freskenreste sienesischer Schule bewahrt; daneben kamen die Reste eines neolithischen Dorfes zutage. In einer anderen Schlucht, Richtung Carbonara, bot eine Felsenkirche basilianischen Mönchen Zuflucht, die vor den Bilderstürmen flohen, und darüber wuchs eine Abtei, die das ganze Mittelalter hindurch Station der Pilger ins Heilige Land war. Heute gehört Modugno zum produktiven Kern von Bari, mit einer der aktivsten Industriezonen des Südens: Bari liegt zehn Minuten entfernt, und die Murgia beginnt hinter der letzten Halle.