En el siglo noveno los benedictinos que administraban esta parte del valle del Treste hicieron una cosa insólita: consagraron a santos mártires las colinas de la zona, una por una. A aquella donde estaba el pueblo le tocó el mártir Buono, y el lugar empezó a llamarse mons Sancti Boni, luego simplemente San Buono. No es sólo un nombre: el cuerpo del mártir está todavía aquí, en la cripta de la parroquial de San Lorenzo, bajo el pueblo que lleva su nombre. En el siglo décimo los Attoni, condes de Chieti, levantaron el castillo en el centro del caserío y las murallas con una sola puerta, la porta da piedi, y el pueblo pasó a ser castrum Bonum. Al seguir siendo posesión eclesiástica, sin embargo, el feudo ni siquiera fue nombrado en el Catalogus baronum de 1152: la lista de los barones del reino se lo salta, porque barones no tenía.
Entre 1315 y 1320 una carestía — o una peste, las fuentes no lo dicen con precisión — golpeó San Buono y la vecina Casalanguida de forma tan grave que los feudos de alrededor tuvieron que contribuir de su bolsillo a poner en pie los dos pueblos. Luego llegaron los Caracciolo, y se quedaron: el feudo pasó a ellos en 1421 por vía dotal, con el matrimonio de Marino I Caracciolo y María di Sangro, y la familia lo tuvo durante catorce generaciones, hasta la abolición del feudalismo en 1806; desde 1590 el pueblo fue incluso un principado, y el primer príncipe hizo construir en 1575, extramuros, el convento de Sant'Antonio. El escudo del municipio, hoy, sigue siendo el suyo. Las colinas, por lo demás, eran sagradas mucho antes de los mártires: en 1986 las excavaciones de Fonte San Nicola sacaron a la luz un santuario frentano del siglo noveno u octavo antes de Cristo, y un segundo santuario estaba entre Pantano y Vusco.