El nombre viene de una leprosería. En la Edad Media, a tres millas de Bolonia, en un campo que se llamaba Ronco Maruni, se construyó un lazareto — la via Emilia era un camino muy transitado, y los caminos transitados llevaban las epidemias — y un documento lo da ya en funcionamiento en 1214. Alrededor de aquel hospital nació el pueblo, que tomó el nombre de su patrón, san Lázaro el mendigo leproso, y fue primero San Lazzaro di Roncomaruno y después solo San Lazzaro. Hay un detalle que vale todo lo demás: al rector que administraba el hospital lo nombraban los propios enfermos, dándole el poder de representarlos y de gestionar sus bienes. El segundo trozo del nombre es el río: Savena, del etrusco, quiere decir vena de agua.
En el escudo está el puente de las Sirenas, que separaba San Lazzaro del territorio pontificio de al lado, el campo en verde y el lema Libertas — que no es una jactancia sino un recuerdo: el municipio nació a comienzos del siglo diecinueve, fue suprimido enseguida y devuelto a Bolonia, y solo recuperó la autonomía en 1827, con un motu proprio del papa. También en el siglo diecinueve el conde Gozzadini sacó a la luz aquí una necrópolis preetrusca: junto con la vecina Villanova, San Lazzaro fue uno de los primeros testigos de la civilización villanoviana. Bajo las colinas, mientras tanto, hay un mundo: unas doscientas grutas excavadas en el yeso, la gruta de la Spipola con su dolina, el Farneto y la Croara, y un complejo cárstico que se desarrolla por más de once kilómetros — el mayor de Europa occidental, hoy patrimonio de la humanidad y protegido por el parque de los Gessi. En Farneto se festeja todavía la Madonna della Cintura por gracia recibida: durante el cólera del siglo diecinueve, en aquella aldea, no murió nadie.