Il patrono di Bagnoregio è san Bonaventura, festeggiato il 15 luglio nella Chiesa di San Bonaventura.
Si ipotizza che la processione notturna del Venerdì Santo abbia avuto inizio a Civita a metà del Seicento, per poi essere trasferita a Bagnoregio per mancanza di figuranti: oggi vi sfilano oltre 300 figuranti in costume, in un'atmosfera di raccoglimento. Durante le festività natalizie, Civita di Bagnoregio si trasforma in una piccola Betlemme per il Presepe vivente, che coinvolge ogni cittadino del luogo il 26 dicembre e il 1° e 6 gennaio. Il paese conserva anche la celebre Civita di Bagnoregio e Porta Santa Maria.
