La patrona di Vernazza è santa Margherita d'Antiochia, festeggiata il 20 luglio. La chiesa parrocchiale a lei dedicata, testimonianza della scuola antelamica iniziata nel 1318, conserva perfettamente le sue tre ampie navate; l'ingresso si apre sul lato dell'abside e l'altare è orientato verso oriente, secondo l'uso liturgico antico, mentre la torre ottagonale, impostata sull'abside, si conclude con una particolare rastremazione dopo un doppio coronamento di archetti.
Il borgo iniziò a popolarsi nell'XI secolo, grazie alla ridotta minaccia saracena dopo la battaglia del 1016, con l'arrivo degli abitanti degli insediamenti sulle alture intorno al santuario di Nostra Signora di Reggio. Il castello Doria, le cui prime notizie risalgono al XIII secolo su un nucleo forse dell'XI, prende il nome dalla famiglia genovese che nel 1273 sconfisse Nicolò Fieschi, il quale tentava di crearsi una signoria indipendente da Genova nel golfo della Spezia: tre anni dopo, nel 1276, Fieschi fu costretto a vendere alla Repubblica tutti i suoi diritti sulla zona.
