Il nome di Basiglio si spiega quasi certamente con il latino basis, il basamento di un cippo stradale: il paese nacque lungo la strada romana che scendeva da Milano verso Pavia. Altre ipotesi tirano in ballo basileus, «re» o «capo», e basei, «pietra miliare». Il primo documento che lo cita è trecentesco e scrive loco de Baxilio, con la x al posto della s; le bande rosse e d'argento dello stemma vengono con ogni probabilità dai conti Birago, titolari dal 1484 del feudo di Mettone, Basiglio compreso.
Il 26 ottobre 1524, dove oggi sorge la cascina Penati, i francesi del maresciallo La Palice ebbero ragione delle truppe spagnole di Ferrante d'Avalos: una vittoria facile, che convinse Francesco I a scendere su Pavia, dove l'assedio si rovesciò nella disfatta del 1525. Negli anni ottanta il quartiere di Milano 3, sorto sull'antica località di Romano Paltano, già comune a sé, ha decuplicato gli abitanti; a Romano Paltano sta anche il municipio.
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Fuori da Basiglio, ma a portata di gita.