I patroni di Fratta Polesine sono i santi Pietro e Paolo, festeggiati il 29 giugno nella Chiesa dei Santi Pietro e Paolo.
A novembre il paese rievoca la rivolta di San Martino contro gli Austriaci dell'11 novembre 1818, con il «Banchetto carbonaro» in costume e una sfilata la domenica pomeriggio nelle vie del centro. Il 26 dicembre si tiene invece il Presepio Vivente, uno dei più longevi del Polesine. Il paese conserva anche la Casa museo di Giacomo Matteotti, nato a Fratta Polesine, e il Museo archeologico nazionale.