Les saints patrons de Scheggia e Pascelupo sont saint Paternien, évêque de Fano, fêté le 12 juillet à Scheggia, et saint Bernardin de Sienne, le 20 mai à Pascelupo : le culte de saint Paternien est partagé avec les villes de Fano, Cervia, Sellano et Grottammare. L'ancienne pieve rurale et baptismale de San Paterniano, érigée vers l'an mille, fut la première église mère de Scheggia ; tombée en décrépitude à cause de sa position isolée, elle fut remplacée au XVIe siècle par l'actuelle église paroissiale des Saints Philippe et Jacques, bâtie à partir de 1535 au cœur du bourg à côté d'une tour médiévale ensuite transformée en clocher. L'église conserve encore les fonts baptismaux en pierre du XIe siècle provenant de l'ancienne pieve et une statue en bois du XVIIe siècle de l'ancien patron, saint Paternien.
Sur le territoire communal se dressent aussi deux anciennes abbayes : celle de Santa Maria di Sitria, fondée par saint Romuald au XIe siècle au pied du Monte Nocria, et celle de Sant'Emiliano in Congiuntoli, probablement fondée par des moines bénédictins au Xe siècle, endommagée par le séisme de 1997 et aujourd'hui en restauration.