I patroni di Troia sono i santi Eleuterio, Urbano, Ponziano, Secondino e Anastasio, festeggiati il 19 luglio.
La sera del Venerdì santo si snoda tra il Corso principale e via Roma la Processione dei Misteri, lunga e scenografica processione di origine spagnola risalente all'inizio del Settecento, che rievoca la Via Crucis. Vi partecipa anche la Processione penitenziale delle Catene, con figuranti incappucciati che, catene legate ai piedi scalzi, percorrono le strade del centro medievale portando una pesante croce in spalla. L'8 marzo si celebra anche san Giovanni di Dio, compatrono della città, con processione e messa solenne. Il paese conserva la Cattedrale di Troia e il Museo ecclesiastico diocesano.