Le saint patron de Comacchio est saint Cassien, dont la fête patronale, le 13 août, est l'un des rendez-vous les plus suivis et attendus de la communauté locale, célébrant le lien profond entre le saint et la ville : le jour de sa mémoire se tient la régate historique avec les embarcations traditionnelles.
Les paroisses patronales des hameaux de San Giuseppe in Bosco Eliceo, datant du XVIIIe siècle, et de Porto Garibaldi, dédiée à l'Immaculée Conception et datant du XIXe siècle, appartiennent aussi au vicariat de San Cassiano dans l'archidiocèse de Ferrare-Comacchio. Depuis 1999, la ville accueille aussi la Fête de l'anguille, tandis que depuis 2006 se tient chaque année la Foire internationale d'observation des oiseaux, liée aux Valli di Comacchio.