La patronne de Santa Marina Salina est sainte Marine, fêtée le 17 juillet, avec l'église qui lui est dédiée au cœur du bourg. Le nom même de la commune dérive de son culte, répandu sur l'île à partir du XVIe siècle : probablement apporté par des colons d'origine vénitienne, arrivés en exil aux îles Éoliennes depuis divers lieux de la Méditerranée en raison de la réduction progressive des territoires de la République de Venise conquis par l'Empire ottoman, sainte Marine étant précisément copatronne de Venise.
Le bourg se trouve sur l'île de Salina, sur les pentes du Monte Fossa delle Felci, le point culminant de tout l'archipel éolien. En 1867, Salina, seule île de l'archipel densément peuplée avec Lipari, fut érigée en commune autonome avec pour chef-lieu Santa Marina ; en 1909, on arriva finalement à la séparation en trois communes actuelles, Santa Marina Salina, Malfa et Leni. Le bourg conserve aussi la zone archéologique du village de Portella, d'origine dorienne.
