La patrona de Santo Stefano Quisquina es santa Rosalía, festejada el martes siguiente al primer domingo de junio, con la ermita a ella dedicada en la Quisquina. Mediante decreto episcopal del 19 de noviembre de 2017, el cardenal Francesco Montenegro, arzobispo metropolitano de Agrigento, declaró también patrono secundario de la ciudad al beato Giacinto Giordano Ansalone, en religión Giordano da Santo Stefano: nacido en el pueblo el 1 de noviembre de 1598, el fraile dominico predicó el Evangelio en México, Filipinas y Japón, donde fue martirizado en Nagasaki el 17 de noviembre de 1634.
La iglesia madre del pueblo, verdadera joya de la arquitectura sacra estefanense, se construyó hacia 1580 y se embelleció con valiosos estucos en la bóveda del presbiterio y el altar mayor de mármol de 1760, cuyo frontal representa las cinco llagas de Cristo en otros tantos trozos de mármol rojo. Entre las fiestas litúrgicas del pueblo, la de san José, el 19 de marzo, incluye la realización de los típicos altares y la procesión del santo por las calles del pueblo.
