En 1467 des émissaires du pape Paul deux vinrent ici arrêter un groupe de personnes, hommes et femmes, accusées d'hérésie. Depuis environ 1300 s'était répandue à Poli la secte des fraticelli, ceux de la vie pauvre, condamnés plusieurs fois par l'Église, et elle avait recueilli beaucoup d'adhésions, y compris celle des Conti qui gouvernaient le fief; les réunions se tenaient en secret en des lieux dispersés, à Casape et ailleurs. Le pape les exhorta d'abord à renier leurs pratiques, puis les fit prendre de force et juger. Le principal accusé était le baron Stefano Conti, coupable d'avoir favorisé le développement de la secte sur ses terres: il fut emprisonné au château Saint-Ange et contraint de renoncer au fief en faveur de ses fils. Avec la population le pape fut plus doux, mais pas plus bref: il imposa à tout le village une pénitence annuelle, une procession le premier jour de Carême et un repas pour douze pauvres du lieu. Cette pénitence fut révoquée en 1886, plus de quatre siècles après avoir été infligée.
Le treize mai 1655, dans l'aile ornée de fresques de l'étage noble du palais Conti, naquit Michelangelo Conti, qui deviendrait pape sous le nom d'Innocent treize. Sa famille tenait Poli depuis six siècles, l'ayant arraché aux Oddoni vers 1200, et aujourd'hui une partie du palais abrite la mairie tandis que l'étage noble est resté aux Conti. Le village remonte à 992 et appartint d'abord à un monastère bénédictin de Rome, puis, à partir de 1081, à l'abbaye de Saint-Paul-hors-les-Murs, par une donation voulue par Grégoire sept. Il est resté tel qu'il était: trente-cinq ruelles très étroites qui s'ouvrent sur une seule longue rue, comme l'arête d'un poisson. Au-dessus se dresse le rocher de Guadagnolo, qui a partagé son sort pendant environ huit cents ans et n'a quitté la même commune qu'en 1930, et que depuis 2010 on rejoint d'ici par la route. Et quatre hommes de Poli furent fusillés aux Fosses ardéatines, en mars 1944.