En 1946, en el campo de este municipio, en Cartoceto, se encontraron los bronces dorados: el grupo está hoy en un museo de la ciudad, y es la razón por la que viene la mayor parte de la gente. La ciudad, en cambio, es más joven de lo que se piensa. Pergola nació como municipio libre en 1234, y nació a propósito: Gubbio, que tenía jurisdicción sobre este territorio, quería un sitio que diera trabajo y comercio a las poblaciones de los castillos de alrededor — y que al mismo tiempo le quitara terreno a Cagli, cuyas posesiones se extendían a lo largo de este mismo fértil valle del Cesano. Funcionó: en pocas décadas el centro se llenó de talleres y se convirtió en un lugar de comercio importante, disputado por los Sforza, los Malatesta, los Montefeltro y los Della Rovere.
Una ciudad hecha con un solo acto tenía sin embargo un interior singular. Dentro de las murallas había cuatro parroquias, y cada una respondía a otro: Santa Maria della piazza al abad de Sitria, San Marco al abad de Nonantola, Sant'Andrea al eremitorio de Fonte Avellana y San Biagio al obispo de Cagli — de modo que el obispo de Gubbio, que debía tener jurisdicción, la tenía solo de nombre. El resto son títulos y dinero: Benedicto XIV hizo de Pergola una Ciudad en 1752; en 1796 se instituyó aquí una ceca, que batió moneda durante tres años; y en 1819 Pío VII le dio una diócesis propia, unida a Cagli solo en la persona del obispo, que estaba obligado a residir seis meses en un sitio y seis meses en el otro.