El patrón de Milazzo es san Esteban protomártir, festejado solemnemente el primer domingo de septiembre. A él está consagrado el duomo nuevo, construido según proyecto del arquitecto Francesco Valenti a partir de 1937 y abierto al culto en 1951.
El copatrón es san Francisco de Paula, que se festeja el primer domingo de mayo; dos días después, normalmente el martes, se celebra la Berrettella, es decir, el gorro que el santo solía llevar durante su estancia en la ciudad, entre 1464 y 1467. De aquella estancia queda también el santuario dedicado a él, el único en Sicilia, construido por su voluntad en aquellos mismos años. Con menos ruido se festeja al protector, san Papino mártir, el 17 y el 28 de junio.
