Il patrono di Chianciano Terme è san Giovanni Battista, festeggiato il 24 giugno. La sua chiesa è la collegiata di San Giovanni Battista, che ha anche un museo proprio.
Nella cappella di sinistra, detta del Battistero, stanno il fonte battesimale circolare in travertino dell'antico battistero e l'affresco della Madonna col Bambino detta Madonna del Castagnolo, di Bartolo di Fredi: due opere del Trecento. Sulla cantoria in controfacciata c'è l'organo costruito nel 1771 da Ignazio Muschietti.