La patrona de Mola di Bari es María Santísima de los Dolores, festejada el segundo domingo de septiembre.
La ciudad vive también con gran intensidad los ritos de la Semana Santa: desde la iglesia dedicada a la Santísima Trinidad parte el Viernes Santo la procesión vespertina de Cristo Muerto, durante la cual los hermanos de San Francisco de Asís entonan a capela el antiquísimo himno latino Vexilla Regis, mientras que el Lunes Santo se celebra la procesión de los Sagrados Misterios. Una cripta, antaño usada para sepulturas, fue transformada en oratorio en 1744 para albergar un relicario con fragmentos de madera atribuidos por la tradición a la Cruz de Cristo, donados al Cabildo de Mola en 1713.