La sainte patronne de Mola di Bari est Notre-Dame des Douleurs, fêtée le deuxième dimanche de septembre.
La ville vit aussi intensément les rites de la Semaine sainte : de l'église dédiée à la Très Sainte Trinité part le Vendredi saint la procession vespérale du Christ mort, durant laquelle les frères de saint François d'Assise entonnent a cappella l'antique hymne latin Vexilla Regis, tandis que le Lundi saint se tient la procession des Saints Mystères. Une crypte, autrefois utilisée pour les sépultures, fut transformée en oratoire en 1744 pour abriter un reliquaire contenant des fragments de bois traditionnellement attribués à la Croix du Christ, offerts au Chapitre de Mola en 1713.
