Le saint patron de Misilmeri est saint Just, dont les reliques sont conservées dans une urne néoclassique en argent réalisée en 1784 par l'orfèvre palermitain Ignazio Richichi. La «Dimostranza di San Giusto» lui est dédiée, un cortège d'une centaine de figurants retraçant les moments marquants de sa vie, rédigé par don Domenico Furitano des barons de Marraffa : en 1771, pour le centenaire de la translation de ses reliques dans le bourg, de grandes festivités furent organisées avec une impressionnante procession figurée.
Le bourg doit son nom au château fait construire par l'émir Jafar II, qui régna sur la Sicile de 998 à 1019 : autour de la forteresse, dont les tours offraient un vaste panorama jusqu'à la mer Tyrrhénienne, se forma un village appelé en arabe Menzel-el-Emir, «village de l'Émir». La Misilmeri actuelle fut fondée en 1540 par le baron Francesco Del Bosco, qui y fit construire en 1553 la nouvelle paroisse San Giovanni Battista, la Madrice, et ouvrit en 1575 la route d'accès au château.
