Il patrono di Modugno è san Nicola da Tolentino, la cui festa si celebra congiuntamente a quella di san Rocco di Montpellier, protettore della città: i due santi vengono festeggiati insieme dal venerdì precedente alla quarta domenica di settembre fino al lunedì successivo. I festeggiamenti prevedono sia manifestazioni popolari, che si svolgono nella giornata di domenica, sia celebrazioni religiose, che si aprono il venerdì e si concludono il lunedì, articolandosi lungo l'intero arco del fine settimana.
Fra i luoghi di culto più significativi della città vi sono la chiesa di Santa Maria del Suffragio, la chiesa di Sant'Agostino, la chiesa di San Giovanni Battista e la chiesa di Santa Maria Immacolata, testimonianze di una lunga tradizione religiosa che accompagna la comunità modugnese nel corso dei secoli.