Patroni di Cisternino sono i santi Quirico e Giulitta, festeggiati la prima domenica di agosto con una solenne processione: la ricorrenza, chiamata più semplicemente «la festa di San Quirico», rappresenta per la popolazione locale e turistica la conclusione del periodo estivo. Co-patrono cittadino è san Nicola di Bari, celebrato il 6 dicembre.
L'8 settembre, giorno della natività della Vergine, gli artigiani cittadini istituirono un'altra celebrazione tradizionale, la fiera dell'8 settembre, portando in processione il gruppo scultoreo della Vergine con la bambina, oggi custodito nella chiesa di San Nicola. Fra le manifestazioni folkloristiche più attese dell'anno vi è anche Pasquetta, chiamata nel dialetto locale «Pasquarèdde». Cisternino, borgo bianco della Valle d'Itria, custodisce inoltre il santuario della Madonna d'Ibernia, insieme a numerosi edifici storici come Palazzo Lagravinese e Palazzo Vescovile.