Il patrono di San Miniato è san Genesio, festeggiato il 25 agosto, e la cattedrale porta il suo nome accanto a quello di Santa Maria Assunta.
Quel nome viene da lontano, cioè da qui sotto: nella piana c'era il borgo di San Genesio, in età altomedievale vicus Wallari, con una chiesa che già nel 763 faceva da pieve. Giovanni Villani racconta che nel 1200 gli abitanti lo lasciarono per trasferirsi nell'attuale San Miniato, e che nel 1248 il borgo fu distrutto del tutto. In memoria della discendenza da quell'antica pieve, nel 1622 la cattedrale di San Miniato fu consacrata a san Genesio; nel borgo restò soltanto una piccola cappella, e oggi gli scavi ne hanno riportato alla luce le strutture.